| 科室 | 复旦专科榜排名(年份) | 国家重点学科(年份) | 国家临床重点专科(年份) | 省重点专科(年份) | 市重点专科(年份) | 院优势专科 | 挂靠中心/实验室资质 |
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| 肾病泌尿学科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 广州市医学重点学科(2025-2027) | 是 | 花都区肾病研究所；血液净化 144 台血透机（市/区单体最大） |
| 消化病学科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 广州市医学重点学科(2025-2027) | 是 | 花都区消化病诊疗中心 |
| 中医老年病科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 广东省"十三五"中医重点专科 | 官方未统一披露 | 是 | 广东省中医重点专科建设单位 |
| 心血管内科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 国家标准化房颤中心、国家胸痛中心协作、胸痛中心广州市排名第二 |
| 神经内科 / 卒中中心 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 国家高级卒中中心、首批广州市卒中急救地图医院 |
| 急诊医学科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 区应急医院依托科室、ECPR 联盟中心医院 |
| 呼吸与危重症医学科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 首批县级慢病呼吸疾病防治中心 | 官方未统一披露 | 是 | 广东省急性呼吸道传染病哨点医院 |
| 产科 / 围产医学科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 花都区重点专科 | 是 | 花都区重症孕产妇救治中心 |
| 骨外科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 花都区重点专科 | 是 | 创伤救治协作 |
| 妇科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 花都区重点专科 | 是 | 妇科微创与盆底诊疗 |
| 神经外科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 花都区重点专科 | 是 | 神经介入与创伤救治 |
| 儿科 | 未进入复旦专科榜前十 | 否 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 国家儿童哮喘标准化门诊单位、广州市级危重儿童救治中心 |
口径说明：①该院为区属三甲，复旦版综合/专科榜、国家临床重点专科批文官方均未统一披露，均标注「官方未统一披露」，不作编造。②省/市重点专科：中医老年病科为广东省「十三五」中医重点专科；消化病学科、肾病泌尿学科为广州市医学重点学科（2025–2027）；呼吸内科、消化病学科、骨外科、妇科、神经外科、围产医学科等 8 个学科为花都区重点专科（2021 年招聘口径）。③「国家临床重点专科」为国家级建设项目口径，该院相关批文以官方发布为准。
